論文作者來復(fù)旦大學(xué)徐彥輝課題組,文章報道了 結(jié)構(gòu)與功能完整的PIC-Mediator復(fù)合物。
結(jié)構(gòu)分析揭示了PIC-Mediator的動態(tài)組裝過程以及Mediator調(diào)控Pol II CTD磷酸化的分子機制。
此前,徐彥輝團隊已在該領(lǐng)域進行了許多突破性研究,這次的論文更為全面地回答了轉(zhuǎn)錄起始過程的若干重要科學(xué)問題,是國內(nèi)分子生物學(xué)領(lǐng)域的又一重大突破性成果。
破解基因研究領(lǐng)域多年來的「難題」
為實現(xiàn)復(fù)雜的基因表達調(diào)控,人體細胞中進化出以RNA聚合酶II(Pol II)為核心的轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC),識別幾乎所有編碼基因和大部分非編碼基因的啟動子區(qū),響應(yīng)各種轉(zhuǎn)錄調(diào)控信號,起始基因轉(zhuǎn)錄。
盡管已有大量基于TBP的PIC復(fù)合物結(jié)構(gòu)研究,但是包含TFIID的完整PIC是如何在不同類型啟動子上進行組裝的,一直沒有得到闡明。對于超過85%以上基因,轉(zhuǎn)錄起始是如何發(fā)生的,是轉(zhuǎn)錄領(lǐng)域長期未能解決的難題。
團隊經(jīng)過多年努力,利用冷凍電鏡方法,解析了PIC組裝過程中所有關(guān)鍵組裝步驟和狀態(tài)的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。
為研究PIC對各種不同類型啟動子的識別,研究人員在涵蓋所有類型的啟動子(三種)上,組裝PIC復(fù)合物并進行了結(jié)構(gòu)分析。得出了26個復(fù)合物結(jié)構(gòu)提供了PIC組裝的不同階段,不同功能狀態(tài),不同啟動子類型的全覆蓋結(jié)構(gòu)信息。
PIC動態(tài)組裝的模式圖
該項工作是近年來轉(zhuǎn)錄領(lǐng)域的重要突破,在分子水平上展示了高度動態(tài)的轉(zhuǎn)錄起始過程,為后續(xù)研究基因表達調(diào)控奠定了理論基礎(chǔ)。
Science雜志的審稿專家認(rèn)為,“該研究成果對今后幾年的真核轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控研究有指導(dǎo)性意義,一經(jīng)發(fā)表,必將成為經(jīng)典。”“這項研究非常優(yōu)秀,標(biāo)志著轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域的巨大進展”“本文揭示的組裝機制引人關(guān)注,作者所做的大量工作值得贊賞”。
該工作也是中國科學(xué)家繼解析剪接體復(fù)合物之后在轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域的又一教科書級的經(jīng)典工作。
這一研究成果的發(fā)布,也標(biāo)志著中國科學(xué)家在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域的基礎(chǔ)科學(xué)研究中取得世界級頂尖成果。
一個月前已發(fā)一篇Science,通訊作者為施一公弟子
徐彥輝教授為論文通訊作者。
就在不久前,徐彥輝團隊的另一篇論文剛剛登陸Science,揭示轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物識別啟動子及動態(tài)組裝的分子機制。
本科畢業(yè)于清華大學(xué)的他,還是施一公的弟子——在饒子和教授(中科院院士)實驗室獲得博士學(xué)位后,即至當(dāng)時還在普林斯頓大學(xué)的施一公教授實驗室,開始了博士后的培養(yǎng)。
復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院助理研究員陳曦子(復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院2019屆博士畢業(yè)生)、陰曉彤(復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)院2018屆博士畢業(yè)生),復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院2016級博士生李佳蓓、2016級博士生武子涵、2017級博士生戚軼倫、2017級博士生王鑫鑫為本文共同第一作者。